目前已有AZ、莫德纳等疫苗共约500万剂抵台，以后民众可能面临混打，即第一剂和第二剂要打不同厂牌的疫苗。专家表示，疫苗混打在科学和学理上都不是问题，关键在如何突破法规限制，指挥中心应先做小规模临床试验，一旦成功，就可进行混打。
长者接种AZ后猝死频传！庄人祥曝“可能原因”：不管打哪牌疫苗都一样台湾目前已进了AZ及莫德纳疫苗共约500万剂，永龄基金会及台积电在政府授权下也将买进1000万剂的辉瑞BNT疫苗，台湾至少会出现AZ、莫德纳及BNT等三种疫苗，以后民众打第一剂、第二剂时可能会是不同厂牌，但混打是否安全，备受社会关注。
对于疫苗是否可以混打，指挥中心的回应是“相关科学实验正在进行”，并未给予肯定答案。不过国外许多科学研究报告都已证明，疫苗是可以混打的，有时候混打的效果还更好。
台湾感染症医学会名誉理事长、台大儿童医院院长黄立民表示，关于疫苗混打，国外已有很多分析研究，都说明安全性没问题。根据国外研究，第一剂打AZ疫苗，第二剂打莫德纳或BNT疫苗，效果很不错；但如果第一剂打莫德纳或BNT疫苗，第二剂仍然要打原厂牌的疫苗，不能打AZ疫苗。
黄立民指出，疫苗混打，并没有太多副作用，安全性也没问题。他认为，国内可以仿照国外经验，尝试进行疫苗混打，再对施打者进行观察，以随时调整处理。
前疾管局长苏益仁则说，国外已有很多研究报告说疫苗可以混打，台湾要跟进，不是科学或学理有问题，关键在于法规。因为根据现行规定，要在国内进行疫苗混打，要雪铁龙行临床实验，确认没问题后，才可以推动。
苏益仁建议指挥中心，如果害怕混打会出问题，那就先做一个小规模的临床实验，譬如召集20至50人，他们第一剂先打AZ疫苗，第二剂则给他们打莫德纳疫苗，然后观察看看反应怎么样，这同时也可当作是第四期临床实验。
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